Une maladie infectieuse est une maladie provoquée par la transmission d'un micro-organisme : virus, bactérie, parasite, champignon. La pathologie infectieuse est l’étude de ces maladies, on s’attache ici aux maladies contagieuses et à leur épidémiologie.

L'objectif est de déterminer une méthodologie qui permet d'analyser, de manière la plus complète possible, le comportement « normal » d'un âne ou d'un mulet, et de déceler d'éventuelles anomalies, maladies ou blessures. Cela sous-entend bien sûr de connaître les maladies liées à des symptômes connus.